Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR47O94967 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
WDR47O94967 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR47O94967 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR47O94967 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR47O94967 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR47O94967 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR47O94967 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR47O94967 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR47O94967 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR47O94967 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR47O94967 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR47O94967 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR47O94967 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR47O94967 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR47O94967 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR47O94967 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR47O94967 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR47O94967 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR47O94967 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR47O94967 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR47O94967 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR47O94967 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR47O94967 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR47O94967 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR47O94967 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR47O94967 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms