Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24DO94855 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms