Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYSFO75923 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DYSFO75923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DYSFO75923 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DYSFO75923 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DYSFO75923 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DYSFO75923 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DYSFO75923 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DYSFO75923 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DYSFO75923 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DYSFO75923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DYSFO75923 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DYSFO75923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DYSFO75923 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DYSFO75923 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DYSFO75923 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DYSFO75923 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DYSFO75923 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DYSFO75923 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DYSFO75923 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DYSFO75923 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DYSFO75923 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DYSFO75923 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms