Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMUO75648 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMUO75648 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMUO75648 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMUO75648 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMUO75648 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMUO75648 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMUO75648 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMUO75648 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMUO75648 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMUO75648 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMUO75648 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMUO75648 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMUO75648 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMUO75648 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMUO75648 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMUO75648 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMUO75648 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMUO75648 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMUO75648 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMUO75648 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMUO75648 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMUO75648 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms