Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LGR5O75473 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGR5O75473 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGR5O75473 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGR5O75473 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGR5O75473 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGR5O75473 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGR5O75473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGR5O75473 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGR5O75473 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGR5O75473 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGR5O75473 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGR5O75473 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LGR5O75473 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGR5O75473 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGR5O75473 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LGR5O75473 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGR5O75473 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LGR5O75473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LGR5O75473 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LGR5O75473 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR5O75473 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR5O75473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR5O75473 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR5O75473 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LGR5O75473 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LGR5O75473 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LGR5O75473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR5O75473 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR5O75473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR5O75473 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR5O75473 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR5O75473 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LGR5O75473 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms