Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED4O75132 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED4O75132 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED4O75132 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED4O75132 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED4O75132 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED4O75132 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED4O75132 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED4O75132 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED4O75132 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED4O75132 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED4O75132 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED4O75132 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED4O75132 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED4O75132 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZBED4O75132 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms