Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN2BO60939 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN2BO60939 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN2BO60939 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms