Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSVO60911 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSVO60911 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSVO60911 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSVO60911 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSVO60911 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSVO60911 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSVO60911 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSVO60911 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSVO60911 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSVO60911 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSVO60911 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSVO60911 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSVO60911 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSVO60911 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSVO60911 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSVO60911 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSVO60911 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSVO60911 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSVO60911 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSVO60911 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSVO60911 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSVO60911 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSVO60911 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSVO60911 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSVO60911 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSVO60911 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSVO60911 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSVO60911 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSVO60911 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSVO60911 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms