Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN1O60635 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN1O60635 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN1O60635 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms