Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR5O60602 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR5O60602 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR5O60602 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR5O60602 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR5O60602 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR5O60602 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR5O60602 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR5O60602 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR5O60602 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR5O60602 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR5O60602 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR5O60602 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR5O60602 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR5O60602 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR5O60602 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR5O60602 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR5O60602 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR5O60602 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR5O60602 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR5O60602 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR5O60602 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR5O60602 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR5O60602 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR5O60602 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR5O60602 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR5O60602 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR5O60602 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR5O60602 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms