Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B3O60423 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP8B3O60423 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms