Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOBOXO60393 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOBOXO60393 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOBOXO60393 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms