Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZEB2O60315 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZEB2O60315 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZEB2O60315 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms