Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA2O43921 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA2O43921 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms