Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPOPO43791 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPOPO43791 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPOPO43791 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPOPO43791 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPOPO43791 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPOPO43791 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPOPO43791 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPOPO43791 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPOPO43791 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPOPO43791 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPOPO43791 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPOPO43791 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPOPO43791 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPOPO43791 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPOPO43791 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPOPO43791 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPOPO43791 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPOPO43791 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPOPO43791 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPOPO43791 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPOPO43791 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPOPO43791 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPOPO43791 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPOPO43791 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPOPO43791 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPOPO43791 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPOPO43791 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPOPO43791 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPOPO43791 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPOPO43791 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPOPO43791 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOPO43791 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOPO43791 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms