Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR3O43761 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR3O43761 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms