Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN4O43707 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN4O43707 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN4O43707 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms