Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRC1O43663 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRC1O43663 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRC1O43663 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRC1O43663 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRC1O43663 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRC1O43663 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRC1O43663 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRC1O43663 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRC1O43663 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRC1O43663 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRC1O43663 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRC1O43663 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRC1O43663 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRC1O43663 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRC1O43663 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRC1O43663 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRC1O43663 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRC1O43663 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRC1O43663 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRC1O43663 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRC1O43663 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRC1O43663 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRC1O43663 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRC1O43663 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRC1O43663 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRC1O43663 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRC1O43663 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRC1O43663 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRC1O43663 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRC1O43663 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRC1O43663 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRC1O43663 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRC1O43663 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRC1O43663 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRC1O43663 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRC1O43663 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRC1O43663 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRC1O43663 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRC1O43663 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRC1O43663 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRC1O43663 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRC1O43663 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRC1O43663 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRC1O43663 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRC1O43663 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRC1O43663 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRC1O43663 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms