Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP2AO43633 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP2AO43633 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP2AO43633 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms