Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
FOXO3O43524 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FOXO3O43524 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOXO3O43524 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms