Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRID2O43424 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRID2O43424 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRID2O43424 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRID2O43424 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRID2O43424 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRID2O43424 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRID2O43424 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRID2O43424 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRID2O43424 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRID2O43424 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRID2O43424 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRID2O43424 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRID2O43424 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID2O43424 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID2O43424 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID2O43424 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID2O43424 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRID2O43424 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRID2O43424 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRID2O43424 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRID2O43424 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID2O43424 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRID2O43424 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms