Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZFHX2-AS1-204ENST00000556613 538 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-10■■■■■ 29.7
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PRPF4O43172 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 49.31□□□□□ -0.921e-12■■■■■ 29.6
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PRPF4O43172 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 29.6
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PRPF4O43172 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-9■■■■■ 29.6
PRPF4O43172 CASP9-211ENST00000546969 569 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 29.6
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PRPF4O43172 CASP9-206ENST00000440484 781 ntTSL 413.45□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 29.6
PRPF4O43172 OXSM-206ENST00000452098 899 ntTSL 213.19□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 29.6
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PRPF4O43172 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 29.6
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PRPF4O43172 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.629e-10■■■■■ 29.6
PRPF4O43172 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 29.6
PRPF4O43172 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.229e-10■■■■■ 29.6
PRPF4O43172 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 223.71■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 29.5
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PRPF4O43172 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 29.5
PRPF4O43172 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 29.5
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PRPF4O43172 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 29.5
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PRPF4O43172 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.4
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PRPF4O43172 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 29.4
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PRPF4O43172 PPARA-207ENST00000460086 433 ntTSL 1 (best)21.78■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 29.4
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PRPF4O43172 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 29.4
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PRPF4O43172 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.578e-9■■■■■ 29.4
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PRPF4O43172 TBCEL-201ENST00000284259 3923 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 29.3
PRPF4O43172 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 29.3
PRPF4O43172 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 29.3
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PRPF4O43172 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 29.2
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PRPF4O43172 NAB1-209ENST00000448811 590 ntTSL 410.65□□□□□ -0.77e-10■■■■■ 29.2
PRPF4O43172 NAB1-204ENST00000416973 568 ntTSL 49.99□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 29.2
PRPF4O43172 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 29.2
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PRPF4O43172 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 29.2
PRPF4O43172 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 29.2
PRPF4O43172 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CTSA-210ENST00000606000 644 ntTSL 311.64□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.239e-8■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.228e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.278e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.678e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 417.19■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 415.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.13□□□□□ -1.913e-7■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 SLC5A6-214ENST00000464538 664 ntTSL 418.78■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 214.2□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 SLC5A6-215ENST00000476319 842 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 29.1
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