Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGSM2O43147 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SGSM2O43147 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGSM2O43147 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms