Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN4O15554 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNN4O15554 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN4O15554 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN4O15554 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms