Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOCS1O15524 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOCS1O15524 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOCS1O15524 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms