Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NUPL2O15504 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUPL2O15504 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUPL2O15504 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms