Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNPHO15079 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNPHO15079 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNPHO15079 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNPHO15079 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNPHO15079 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNPHO15079 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNPHO15079 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNPHO15079 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNPHO15079 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNPHO15079 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNPHO15079 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNPHO15079 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNPHO15079 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNPHO15079 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNPHO15079 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNPHO15079 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNPHO15079 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNPHO15079 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNPHO15079 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNPHO15079 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNPHO15079 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNPHO15079 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNPHO15079 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNPHO15079 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNPHO15079 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms