Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16AO15027 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC16AO15027 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms