Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF646O15015 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF646O15015 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF646O15015 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms