Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 YOL163WYOL163W 510 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 CAR1YPL111W 1002 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 NTE1YML059C 5040 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 RSP5YER125W 2430 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.46□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 DJP1YIR004W 1299 nt7.46□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 CIS3YJL158C 684 nt7.46□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 ERG3YLR056W 1098 nt7.46□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 ISC1YER019W 1434 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YDL114WYDL114W 927 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 MRPL1YDR116C 858 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 RRP4YHR069C 1080 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YUR1YJL139C 1287 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 ICT1YLR099C 1185 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 ARA2YMR041C 1008 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YOR342CYOR342C 960 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YPL041CYPL041C 624 nt7.46□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YMR155WYMR155W 1644 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 APE3YBR286W 1614 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 SKY1YMR216C 2229 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YML083CYML083C 1257 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 ARR3YPR201W 1215 nt7.45□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 IMA5YJL216C 1746 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 HSM3YBR272C 1443 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YHL017WYHL017W 1599 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 MRPL36YBR122C 534 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 KNS1YLL019C 2214 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 GIT1YCR098C 1557 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 RRP45YDR280W 918 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 SEC20YDR498C 1152 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 DPH5YLR172C 903 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 IFA38YBR159W 1044 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 GYP8YFL027C 1494 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 FRS2YFL022C 1512 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YCL041CYCL041C 495 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 AGP2YBR132C 1791 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YDR109CYDR109C 2148 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 GLN3YER040W 2193 nt7.4□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 YML133CYML133C 4125 nt7.4□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 MNN5YJL186W 1761 nt7.4□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 PAN6YIL145C 930 nt7.4□□□□□ -1.22
YRF1-4O13559 MRPL13YKR006C 795 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YBR144CYBR144C 315 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 PSY4YBL046W 1326 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 TOS2YGR221C 1869 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 PGK1YCR012W 1251 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 PRM10YJL108C 1152 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YLR283WYLR283W 945 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YPL062WYPL062W 405 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 RPS9AYPL081W 594 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 MRC1YCL061C 3291 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 VTS1YOR359W 1572 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 AMD1YML035C 2433 nt7.36□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 COX9YDL067C 180 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YNL019CYNL019C 855 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YNL033WYNL033W 855 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YPR123CYPR123C 435 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 ACO1YLR304C 2337 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 APS3YJL024C 585 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 YNR042WYNR042W 429 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-4O13559 SSK22YCR073C 3996 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 UBP13YBL067C 2244 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YDR154CYDR154C 351 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YJU3YKL094W 942 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 PRP2YNR011C 2631 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 FET4YMR319C 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 ORC5YNL261W 1440 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 ATO3YDR384C 828 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 PPM1YDR435C 987 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 VMA4YOR332W 702 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YGL036WYGL036W 2730 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 GAA1YLR088W 1845 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 GAT1YFL021W 1533 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YJR015WYJR015W 1533 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 ECM30YLR436C 3825 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 QNS1YHR074W 2145 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 VRP1YLR337C 2454 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YCL065WYCL065W 369 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 CSG2YBR036C 1233 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 YKR023WYKR023W 1593 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 NMD5YJR132W 3147 nt7.29□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SHM1YBR263W 1473 nt7.29□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 PFK2YMR205C 2880 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 MRS1YIR021W 1092 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 PGU1YJR153W 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 151.4 ms