Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAP18O00422 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAP18O00422 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAP18O00422 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAP18O00422 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAP18O00422 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAP18O00422 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAP18O00422 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAP18O00422 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAP18O00422 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAP18O00422 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAP18O00422 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAP18O00422 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SAP18O00422 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAP18O00422 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAP18O00422 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAP18O00422 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAP18O00422 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAP18O00422 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAP18O00422 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAP18O00422 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAP18O00422 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAP18O00422 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAP18O00422 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAP18O00422 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAP18O00422 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP18O00422 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP18O00422 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP18O00422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP18O00422 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP18O00422 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAP18O00422 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP18O00422 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms