Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE2AO00408 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE2AO00408 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE2AO00408 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE2AO00408 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE2AO00408 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE2AO00408 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE2AO00408 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms