Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC7O00311 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC7O00311 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC7O00311 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC7O00311 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC7O00311 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC7O00311 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC7O00311 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC7O00311 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC7O00311 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC7O00311 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC7O00311 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC7O00311 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC7O00311 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC7O00311 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC7O00311 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC7O00311 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC7O00311 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC7O00311 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC7O00311 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC7O00311 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC7O00311 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC7O00311 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC7O00311 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms