Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF10AO00220 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10AO00220 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10AO00220 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms