Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP23O00161 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms