Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms