Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPH6UMI1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms