Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGFBR3LH3BV60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3LH3BV60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms