Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP17L23D6RBM5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP17L23D6RBM5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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