Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM233B4DJY2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM233B4DJY2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM233B4DJY2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms