Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO5BA8MYB1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO5BA8MYB1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO5BA8MYB1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms