Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB2A8KAH6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB2A8KAH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms