Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFI1A8K8P3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFI1A8K8P3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFI1A8K8P3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms