Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA1A8K7I4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA1A8K7I4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA1A8K7I4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms