Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF839A8K0R7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms