Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ3A6PVS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ3A6PVS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms