Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM2BA6NLU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms