Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMIM23A6NLE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms