Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF25A6NGN4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF25A6NGN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms