Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM247A6NEH6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms